Senteret har en senterledelse bestående av senterleder, to nestledere og en administrativ leder.
Senteret vil ha et styre bestående av styreleder og ett medlem fra hver av partnerinstitusjonene (Diakonhjemmet Sykehus, Oslo Universitetssykehus, Universitetet i Oslo, Norsk Revmatikerforbund og stiftelsen MAGIC).
Senteret vil videre ha en strategisk styringsgruppe som vil være ansvarlig for de overordnede strategiske valgene i senteret. Den strategiske styringsgruppen vil bestå av senterledelsen, arbeidspakkeledere, andre vitenskapelige nøkkelpersoner fra partnerinstitusjonene og leder av REMEDY Pasientråd.
Driftsledelsen vil bestå av senterledelse, arbeidspakkeledere/nestledere, leder for klinisk utprøvingsenhet og ledere for nasjonalt klinisk nettverk. Driftsledelsen vil være ansvarlig for den daglige driften av prosjektene i senteret.